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更新时间:2025-08-11 22:39:49 | 浏览次数:0590


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  科研团队还提出了一种基于单倍型图谱的基因组分型新策略,可更高效、更经济解决分型难题。历史性马铃薯品种基因组中单倍型有限,而马铃薯通过块茎传播、基因组重组次数少,这意味着现代品种基因组存在大片段高度保守序列。结合这一科学发现,利用tetraDecoder解析的40套历史性单倍型基因组构建单倍型图并以其建立参考系,通过短读长序列比对和图遍历算法设计与优化,可以更高效、更经济地重建现代品种的单倍型基因组。以当今仍用来炸薯条的‘Russet Burbank’(源于1908年)等品种为例验证了新策略的有效性,其花费仅为tetraDecoder方法的5%。

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  科研团队构建了国际首个单倍型解析的四倍体马铃薯泛基因组,解码了种群85%的遗传变异。分析发现:(1)基因组中单倍型序列差异极其显著(约2%)。团队推测该现象与野生种质大规模基因渗入有关。序列多样性为马铃薯适应环境奠定了遗传基础,也为分子生物学研究增加了复杂性。(2)基因组中特异单倍型数量非常有限。在40套单倍型基因组中,任意10-kb窗口内平均仅9个特异单倍型。这一现象恰如厨房灶台上摆满了调味瓶,但里面非糖即盐,味道有限。团队推测这源于马铃薯在驯化、传播与环境适应过程中所经历的多次遗传瓶颈。“超高杂合度+有限单倍型”遗传多样性特征为马铃薯现代育种指明了方向:追求产量和品质同时,应注重(如引入外源基因或利用基因组编辑等技术)提升单倍型多样性,以增强其抗病性、抗逆性和环境适应能力。

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